Está ubicado en la Autopista Cuenca Azogues KM 10 Y 1/2 Entrada Frente a Hospital del Río, el zoológico Amaru fue inaugurado en el año 2.003. Cuenta con una colección de más de 120 especies de animales vivos, de los cuales, la mayoría pertenecen al Ecuador. Dentro de esta muestra se incluyen anfibios, reptiles y peces. Además, en el centro opera el servicio de rescate de animales en tráfico. En este lugar se exhibe permanentemente más de 250 especies de anfibios, peces y reptiles. En la mayoría de los casos, provienen de hábitat con temperatura superior a los 25 grados. El primer animal que llevaron al zoológico fue una boa a la que en lengua shuar se la conoce como Amaru, de ahí su nombre. En este lugar encontramos acuarios donde se conservan gran variedad de animales acuáticos. El cuidado de estas especies es una base para el desarrollo y estudio de su forma de vida. En este centro funcionan el laboratorio de dietas y el bioterio, un lugar dedicado a la crianza de los ratones utilizados para la alimentación de los animales, además de grillos, lagartijas y pollos para el consumo de los reptiles, anfibios y ofidios y para los peces hay alimento congelado.
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